对于慢性肺脓肿患者施行手术，术者应做好充分的思想准备和物质准备，此类手术难度大，粘连重，出血多，手术时间长，术后并发症多，死亡率高。

多数肺脓肿患者需做肺叶切除，有时候甚至被迫做一侧全肺切除。

首先，肺脓肿界限不清，可能跨叶间裂生长，累及邻近肺叶或肺段，将血管包埋其中，解剖时找不到组织层次；而反复的炎症也导致血管致密粘连于支气管上，术中企图将血管分离出来尤其困难，稍有不慎就会出现损伤血管而无法止血；

其次，肺脓肿的外壁纤维组织粘连严重，稍有不慎，一旦破溃，就会出现手术野的感染，这也是术后脓胸、切口感染发生率高的原因；

另外，长期慢性炎症，胸腔粘连形成，血管增生，手术创面大，术中出血较多，患者本身因长期慢性炎症，机体处于消耗状态，加上手术打击及术中大量失血的打击，术后恢复困难，既往20-30年前，肺脓肿是胸外科最常见的死亡原因。

对于一些术中的预处理，常常可以有效避免一些此类情况的发生，比如：术中准备肺门止血带，将肺门，包块肺动脉、静脉、支气管一并结扎，一旦发生大出血，收紧肺门止血带，就可以为下一步的修补争取足够的时间，不至于迫不得已行全肺切除；另外比如术中反复稀碘伏冲洗胸腔、手术切口等，反复纤维支气管镜吸痰，术中做好肺隔离措施等，可以有效预防术后肺部感染、切口感染等并发症的发生。